Центр подготовки специалистов пограничного контроля Института является приемником школы сержантского состава по подготовке младших контролеров для отделений пограничного контроля, созданной на базе ОКПП «Брест». За весь исторический период неоднократно менялось название учебного подразделения, но цели и задачи оставались неизменными.
1961 год Школа сержантского состава по подготовке младших контролеров ОКПП «Брест»
1992 год Школа по подготовке прапорщиков
1995 год Курсы по подготовке, переподготовке и повышению квалификации прапорщиков
1997 год Центр подготовки прапорщиков
2010 год Центр подготовки специалистов пограничного контроля ГУО «Институт пограничной службы Республики Беларусь»
С 2012 года Центр подготовки специалистов пограничного контроля осуществляет подготовку младших офицеров из числа прапорщиков проходящих службу на офицерских должностях в подразделениях пограничного контроля органов пограничной службы Республики Беларусь.
2015 год В составе ГУО «ИПС РБ» центр прошел сертификацию на соответствие требованиям системы менеджмента качества СТБ ISO 9001-2009
Сегодня в Центре подготовки специалистов пограничного контроля успешно решаются задачи совершенствования профессиональной подготовки сотрудников подразделений пограничного контроля, внедряются в образовательный процесс новые образовательные программы, формы, методики и средства обучения, развивается учебная и материально-техническая база.
Ежегодно в Центре проходит обучение до 400 слушателей. В том числе проводится подготовка до 50 младших офицеров и до 90 прапорщиков.